Что делать, если в XML карту сайта не попадают разделы инфоблока?

Это всего лишь означает, что разделы инфоблока не индексируются. Чтобы исправить это, нужно сделать:

1. В настройках инфоблока, на вкладке "Инфоблок", поставить галочку "Индексировать разделы для модуля поиска".
2. Отправить разделы на переиндексацию, с помощью инструмента "Переиндексация сайта", который можно найти в меню "Поиск - Переиндексация", раздела "Настройки".
3. По новой сгенерировать XML карту сайта, с помощью инструмента "Поиск - Google Sitemap" из того же раздела.