Конфликт с JQuery "$ undefined"

Если при компиляции сборщик ругается на то, что $ undefined, то принимаем во внимание то, что: 

1. JQuery и Bootstrap уже автоматом подключены в /resources/assets/js/bootstrap.js, который инклюдится в /resources/assets/js/app.js
2. Соответственно /resources/assets/js/app.js должен подключаться первым в методе mix.js

Кроме того, в этих файлах комментируем получение токена, если не собираемся его использовать. И vue.js, если не пользуемся и этим компонентом.